Hlavní cíle asociace spočívají především v následujících oblastech
podporovat rozvoj výzkumu a vzdělávání ve všech přírodovědných oborech a matematice
zastřešovat a harmonizovat komunikaci mezi představiteli fakult přírodovědného zaměření
koordinovat společný postup zapojených fakult v zásadních záležitostech týkajících se českého vysokého školství
přispívat do diskuze s politickou reprezentací o financování české vědy a jejím dalším směřování a rozvoji
přispívat podněty týkajícími se koncepčního a dlouhodobého rozvoje vědeckého výzkumu na národní úrovni
přispívat k formulování společného postoje a názoru a ve věcech společného zájmu komunikovat s dalšími subjekty, např. biomedicínskými, zemědělskými a technickými obory
podílet se na odstraňování legislativních a administrativních překážek pro širokou meziresortní a mezinárodní spolupráci
vytvářet podmínky pro spolupráci vědy s praxí a aplikace výzkumu v praxi
podporovat a rozvíjet kvalitní vzdělávání středoškolských učitelů ve všech oborech, motivovat mladé lidi k volbě učitelského povolání a formulovat společný postoj s fakultami zajišťující učitelství.
popularizovat, propagovat a medializovat nejlepší výsledky českého základního i aplikovaného výzkumu